Текст книги "Жизнь, которую мы создали. Как пятьдесят тысяч лет рукотворных инноваций усовершенствовали и преобразили природу"

Библиография

Приведенный на этих страницах аннотированный список источников ни в коем случае не полон. Я составляла его с мыслью познакомить читателя с источниками, которые помогут глубже исследовать основные темы книги. По возможности я старалась указывать и статьи, где в доступной форме дается обзор основной научной литературы, и статьи, написанные для широкого круга читателей. В некоторых случаях, когда я ссылаюсь на конкретные наборы данных или публикации, я включаю и указания на источник этих данных.

Пролог. Мысли о будущем

Аннотированная библиография

Пересадка гоноцитов, упоминаемая мною в связи с тем, что куры могут нести яйца, из которых потом вылупятся утята (Liu et al. 2012), имеет множество преимуществ, в частности, дает возможность животным обычных пород и видов становиться суррогатными родителями для более редких пород и видов, которые трудно разводить в неволе. Например, распространенные породы кур часто использовались для разведения цыплят более редких пород (Woodcock et al. 2019). Эта технология успешно применялась и у рыб и крайне перспективна для сельского хозяйства и охраны природы.

Техническое описание экосвиньи приведено в статье Forsberg et al. 2003. Экосвиньи и некоторые другие трансгенные животные, до сих пор не преодолевшие все бюрократические препоны, описаны в работе Block 2018, и эти описания доступны и для читателей-непрофессионалов.

Споры о том, что лучше для биоразнообразия – оставить природу в покое или прибегать к более агрессивному вмешательству, – имеют глубокие корни в истории сохранения биоразнообразия. Одну из сторон возглавляет Э. О. Уилсон, который излагает свои доводы в пользу того, чтобы обеспечить природе простор для восстановления, в своей книге Wilson 2016. По другую сторону находятся те из нас, кто убежден, что уже поздно воображать, будто наша деятельность не затронула хоть какую-то часть планеты, и потому нам нужно взять на себя роль кураторов Земли. Две мои любимые книги, посвященные этой точке зрения: Brand 2009 и Marris 2011.

Первоначальный отчет об отношении жителей Новой Зеландии к биотехнологическим решениям проблемы сохранения биоразнообразия можно найти в работе Taylor et al. 2017a, а обсуждение выводов из этого исследования – в работе Taylor et al. 2017b.

Литература

Bloch S. 2018. Hornless Holsteins and Enviropigs: The genetically engineered animals we never knew. The Counter.

Brand S. 2009. Whole Earth Discipline: An Ecopragmatist Manifesto. New York: Viking Penguin.

Forsberg C. W. et al. 2003. The Enviropig physiology, performance, and contribution to nutrient management advances in a regulated environment: The leading edge of change in the pork industry. Journal of Animal Science 81: E68 – E77.

Liu C. et al. 2012. Production of chicken progeny (Gallus gallus domesticus) from interspecies germline chimeric duck (Anas domesticus) by primordial germ cell transfer. Biology of Reproduction 86: 1–8.

Marris E. 2011. Rambunctious Garden: Saving Nature in a Post-Wild World. New York: Bloomsbury.

Taylor H. R. et al. 2017a. Bridging the conservation genetics gap by identifying barriers to implementationfor conservation practitioners. Global Ecology and Conservation 10: 231–242.

Taylor H. R. et al. 2017b. De-extinction needs consultation. Nature Ecology and Evolution 1: 198.

Wilson E. O. 2016. HalfEarth: Our Planet’s Fight for Life. New York: Liveright.

Woodcock M. E. et al. 2019. Reviving rare chicken breeds using genetically engineered sterility in surrogate host birds. Proceedings of the National Academy of Sciences 116: 20930–20937.

Yoshizaki G., Yazawa R. 2019. Application of surrogate broodstock technology in aquaculture. Fisheries Science 85: 429–437.

Глава 1. Костяные прииски

Аннотированная библиография

Оценки потенциала растительных (Zazula et al. 2003) и животных (Shapiro, Cooper 2003) остатков, сохранившихся в замерзшей почве канадского Юкона, для реконструкции древних экосистем подчеркивают, как много клондайкские золотые прииски могут рассказать о бурной истории ледниковых периодов плейстоцена. Как составлять хронологию тех событий по слоям вулканического пепла, относительно доступно рассказывает Фрезе с коллегами (Froese et al. 2009).

Об истории североамериканского бизона написано много. Среди самых подробных исторических отчетов следует упомянуть работу Ринеллы (Rinella 2009), пусть даже ее автор и потешается над моим заокеанским акцентом, которым я заразилась к концу пребывания в Оксфорде (и который наверняка с тех пор утратила). Об отношениях индейцев и бизонов в средней части континента подробно и увлекательно рассказывает Гейст (Geist 1996), а воздействие бизонов на экосистему Берингии и отношения между разновидностями бизонов в Берингии и других местах исследует Гатри (Guthrie 1989).

Падение численности бизонов в XIX веке хорошо задокументировано в работе Hornaday 1889, а влияние этого падения численности на североамериканские экосистемы исследует Йонг (Yong 2018). Подробные описания попыток спасти бизонов, предпринятых в XIX и начале XX века, сохранились в разнообразных отчетах Американского общества охраны бизонов того периода, которые можно найти в онлайн-архивах общества.

Попытки скрещивать бизонов с коровами, предпринятые в начале XX века, по большей части были неудачными (Goodnight 1914), тем не менее в большинстве бизоньих стад прослеживаются гены коров (Halbert, Derr 2009). Физические проявления коровьей наследственности у бизонов острова Санта-Каталина оценивает Дерр с коллегами (Derr et al. 2012).

Моя работа по реконструкции истории бизонов на основании древней ДНК началась с вывода, что их популяции на протяжении последнего ледникового периода росли и сокращались (Shapiro et al. 2004). Затем мы выделили ДНК из бизоньей ноги из Чьиджи-Блафф и из черепа длиннорогого бизона из Сноумасса в штате Колорадо, чтобы определить, когда бизоны в первый раз пришли в Северную Америку (Froese et al. 2017), и задокументировали восстановление популяции после пика последнего ледникового периода (Heintzman et al. 2016). О наших раскопках в Сноумассе сняли эпизод телесериала NOVA на канале Пи-Би-Эс (Grant 2012).

Первая успешная амплификация древней ДНК из сохранившейся шкуры квагги описана в работе Хигучи с коллегами (Higuchi et al. 1984). Все дальнейшие смелые заявления о получении ДНК динозавров и из более древних ископаемых находок были развенчаны, когда исследователи разработали и применили протоколы, позволявшие избежать загрязнения, и оценили эти результаты; обзор см. в работах Гилберта (Gilbert et al. 2005) и Шапиро и Хофрайтера (Shapiro, Hofreiter 2014). Первые правила работы в этом поле сформулированы в работе Cooper, Poinar 2000.

Литература

Cooper A., Poinar H. N. 2000. Ancient DNA: Do it right or not at all. Science 289: 1139.

Derr J. N. et al. 2012. Phenotypic effects of cattle mitochondrial DNA in American bison. Conservation Biology 26: 1130–1136.

Froese D. G. et al. 2017. Fossil and genomic evidence constrains the timing of bison arrival in North America. Proceedings of the National Academy of Sciences 114: 3457–3462.

Froese D. G. et al. 2009. The Klondike goldfields and Pleistocene environments of Beringia. GSA Today 19: 4–10.

Geist V. 1996. Buffalo Nation: History and Legend of the North American Bison. Stillwater, MN: Voyageur Press.

Gilbert M. T. P. et al. 2005. Assessing ancient DNA studies. Trends in Ecology and Evolution 20: 541–544.

Goodnight C. 1914. My experience with bison hybrids. Journal of Heredity 5: 197–199.

Grant E. 2012. Ice Age Death Trap. NOVA, PBS. www.youtube.com/ watch?v=MLo-ScSbJ54/

Guthrie R. D. 1989. Frozen Fauna of the Mammoth Steppe. Chicago, IL: University of Chicago Press.

Halbert N. D., Derr J. N. 2007. A comprehensive evaluation of cattle introgression into US federal bison herds. Journal of Heredity 98: 1–12.

Heintzman P. D. et al. 2016. Bison phylogeography constrains dispersal and viability of the «Ice Free Corridor» in western Canada. Proceedings of the National Academy of Sciences 113: 8057–8063.

Higuchi R. et al. 1984. DNA sequences from the quagga, an extinct member of the horse family. Nature 312: 282–284.

Hornaday W. T. 1889. Extermination of the American Bison. In: Smithsonian Institution USNM, ed. Report of the National Museum: Government Printing Office, pp. 369–548.

Johnson K. R. et al. 2014. The Snowmastodon Project. Quaternary Research 82: 473–476.

Rinella S. 2009. American Buffalo: In Search of a Lost Icon. New York: Spiegel & Grau.

Shapiro B., Cooper A. 2003. Beringia as an Ice Age genetic museum. Quaternary Research 60: 94–100.

Shapiro B. et al. 2004. Rise and fall of the Beringian steppe bison. Science 306: 1561–1565.

Shapiro B., Hofreiter M. 2014. A paleogenomic perspective on evolution and gene function: New insights from ancient DNA. Science 343: 1236573.

Yong E. November 18, 2019. What America lost when it lost the bison. The Atlantic.

Zazula G. D. et al. 2003. Ice-age steppe vegetation in East Beringia. Nature 423: 603.

Глава 2. Откуда мы взялись

Аннотированная библиография

Понятие биологического вида ввел Эрнст Майр (Mayr 1942, Майр 1947), хотя свои сторонники есть и у других определений видов. В книге Койна и Орра (Coyne, Orr 2004) дается подробнейший обзор всех концепций видов и рассказывается, как эволюционировало наше представление о них.

Что говорят ископаемые о происхождении нашей линии, всесторонне и доступно описано в книгах Хэмфри и Стрингера (Hum phrey, Stringer 2018) и Стрингера и Макки (Stringer, McKie 2015), хотя читатели, которым трудно подолгу удерживать на чем-то внимание, предпочтут, пожалуй, более сжатую версию (Stringer 2016). Другой прекрасный вариант – книга Кермита Паттисона (Pattison 2020), особенно для тех читателей, кто интересуется еще и межличностными конфликтами в палеоантропологии. Эволюцию предгоминин, особенно эволюцию прямохождения, исследует Либерман (Liberman 2014, Либерман 2018). Взаимодействие между засушливостью в Африке и диверсификацией раннего Homo изучается в статье Сьюзан Антон и ее коллег (AntÓn et al. 2014). Останки современного человека, жившего 315 000 лет назад в Джебель-Ирхуд в Марокко, описаны в статье Жан-Жака Хеблина с коллегами (Hublin et al. 2017). Первое описание Homo naledi дают Бергер с коллегами (Berger et al. 2015). Инструкции по тому, как напечатать фрагменты H. naledi на 3D-принтере, размещены на странице проекта Rising Star на сайте MorphoSource (www.morphosource.org/ projects/0000 °C124)

Хотя в археологических данных присутствуют некоторые признаки внезапной перемены в поведении людей (краткое описание см. в Mellars 2006), большинство палеоантропологов убеждены, что эволюция поведения человека была процессом медленным и сложным (McBrearty, Brooks 2000). Обзор дебатов по этому поводу в доступной большинству читателей форме дает Вурц (Wurz 2012).

Исследования древней ДНК неандертальцев начались в 1997 году (Krings et al. 1997), однако лишь Грину с коллегами (Green et al. 2010) удалось показать, что эти данные говорят о глубочайшей взаимосвязи историй наших линий. Начиная с 2010 года то, что люди часто обменивались генами с нашими архаическими родственниками, было многократно подтверждено, в том числе с опорой на древнюю ДНК неандертальцев (PrÜfer et al. 2014, Hajdinjak et al. 2018,

Mafessoni et al. 2020), денисовцев (Reich et al. 2010, Meyer et al. 2012, Sawyer et al. 2015) и гибридов неандертальцев и денисовцев (Slon et al. 2018), а также на основе анализов древней ДНК, сохранившейся у древних и ныне живущих современных людей (Fu et al. 2016,

Browning et al. 2018). Вывод, что денисовцы населяли более обширные территории, был изначально сделан на основании секвенирования белков, выделенных из ископаемых на Тибетском нагорье (Chen et al. 2019), а затем подтвержден данными древней ДНК, прямо выделенной из осадочных пород на полу пещеры (Zhang et al. 2020). О данных ядерных ДНК из останков, обнаруженных в пещере Сима де лос Уэсос в Испании, сообщает Мейер с коллегами (Meyer et al. 2019).

Сегодня в геномах всех или по крайней мере большинства из нас содержатся небольшие фрагменты ДНК, унаследованных в результате смешения с нашими архаическими родственниками (Vernot,

Akey 2015, Chen et al. 2020). О том, как ДНК, перешедшая в человеческие линии в результате смешения с архаическими родственниками, повлияла на эволюционную историю нашего вида, рассуждает Расимо с коллегами (Racimo et al. 2015). Что все это значит для нашей эволюции, подробно и популярно рассказывает Уэй-Хасс (Wei-Hass 2020).

О том, как выращивают и анализируют мозговые органоиды с геномами, в которые методами генной инженерии введена архаическая версия NOVA1, рассказано в статье Трухильо с коллегами (Trujillo et al. 2021).

Литература

AntÓn S. et al. 2014. Early evolution of Homo: An integrated biological perspective. Science 345: 1236828.

Berger L. R. et al. 2015. Homo naledi, a new species of the genus Homo from the Dinaledi Chamber, South Africa. eLife 4: e09560.

Browning S. R. et al. 2018. Analyses of human sequence data reveals two pulses of archaic Denisovan admixture. Cell 173: 53–61.e9.

Chen F. et al. 2019. A late Middle Pleistocene mandible from the Tibetan Plateau. Nature 569: 409–412.

Chen L. et al. 2020. Identifying and interpreting apparent Neanderthal ancestry in African individuals. Cell 180: 677–687.e16.

Coyne J. A., Orr H. A. 2004. Speciation. Sunderland, MA: Sinauer.

Fu Q. et al. 2016. The genetic history of Ice Age Europe. Nature 534: 200–205.

Green R. E. et al. 2010. A draft sequence of the Neandertal genome. Science 328: 710–722.

Hajdinjak M. et al. 2018. Reconstructing the genetic history of late Neanderthals. Nature 555: 652–656.

Hublin J. J. et al. 2017. New fossils from Jebel Irhoud, Morocco, and the pan-African origin of Homo sapiens. Nature 546: 289–292.

Huerta-SÁnchez E. et al. 2014. Altitude-adaptation in Tibetans caused by introgression of Denisovan-like DNA. Nature 512: 194–197.

Humphrey L., Stringer C. 2018. Our Human Story. London: Natural History Museum.

Krings M. et al. 1997. Neandertal DNA sequences and the origin of modern humans. Cell 90: 19–30.

Liberman D. 2014. The Story of the Human Body: Evolution, Health, and Disease. New York: Random House. [Либерман Д. История человеческого тела: эволюция, здоровье и болезни. М.: Карьера-пресс, 2018.]

Mafessoni F. et al. 2020. A high-coverage Neandertal genome from Chagyrskaya Cave. Proceedings of the National Academy of Sciences 117: 15132–15136.

Mayr E. 1942. Systematics and the Origin of Species. New York: Columbia University Press. [Майр Э. Систематика и происхождение видов с точки зрения зоолога. М.: Государственное издательство иностранной литературы, 1947.]

McBrearty S., Brooks A. S. The revolution that wasn’t: A new interpretation of the origin of modern human behavior. Journal of Human Evolution 39: 453–563.

Mellars P. 2006. Why did modern human populations disperse from Africa ca. 60,000 years ago? A new mode. Proc eedings of the National Academy of Sciences 103: 9381–9386.

Meyer M. et al. 2012. A high-coverage genome sequence from an archaic Denisovan individual. Science 338: 222–226.

Meyer M. et al. 2016. Nuclear DNA sequences from Middle Pleistocene Sima de los Huesos hominins. Nature 531: 504–507.

Pattison K. 2020. Fossil Men: The Quest for the Oldest Skeleton and the Origins of Humankind. New York: HarperCollins.

PrÜfer K. et al. 2017. A high-coverage Neandertal genome from Vinfija Cave in Croatia. Science 358: 655–658.

PrÜfer K. et al. 2014. The complete genome sequence of a Neanderthal from the Altai Mountains. Nature 505: 43–49.

Reich D. et al. 2010. Genetic history of an archaic hominin group from Denisova Cave in Siberia. Nature 468: 1053–1060.

Sawyer S. et al. 2015. Nuclear and mitochondrial DNA sequencefrom two Denisovan individuals. Proceedings of the National Academy of Sciences 112: 15696–15700.

Slon V. et al. 2018. The genome of the offspring of a Neanderthal mother and a Denisovan father. Nature 561: 113–116.

Stringer C., Makie R. 2015. African Exodus: The Origins of Modern Humanity. New York: Henry Holt & Co.

Stringer C. 2016. The origin and evolution of Homo sapiens. Philosophical Transactions of the Royal Society of London, Series B 371: 20150237.

Trujillo C. A. et al. 2021. Reintroduction of archaic variant of NOVA1 in cortical organoids alters neurodevelopment. Science 381: eaax2537.

Vernot B., Akey J. M. 2015. Complex history of admixture between modern humans and Neandertals. American Journal of Human Genetics 96: 448–453.

Wei-Haas M. January 30, 2020. You may have more Neanderthal DNA than you think. National Geographic.

Wurz S. The transition to modern behavior. Nature Education Knowledge 3:15.

Zhang D. et al. 2020. Denisovan DNA in Late Pleistocene sediments from Baishiya Karst Cave on the Tibetan Plateau. Science 370: 584–587.

Глава 3. Блицкриг

Аннотированная библиография

Данные за и против того, что люди в последние 50 000 лет были главной причиной вымираний, пересматривались разными авторами (см.

Barnosky et al. 2004, Koch, Barnosky 2006, Stuart 2014). Нынешний кризис вымирания и его связь с ростом популяции человека и изменениями в природопользовании описывают Кебаллос и его коллеги (Ceballos et al. 2017).

О вымирании шерстистых носорогов подробно пишут Стюарт и Листер (Stuart, Lister 2012). Статистику остатков шерстистых носорогов на археологических раскопках в Евразии приводит Лорензен с коллегами (Lorenzen et al. 2011). О вымирании сибирских единорогов можно прочитать в статье Козинцева и его соавторов (Kosintev et al. 2019).

О первом применении древней ДНК и популяционной генетики с целью реконструировать колебания размеров популяции вымершего вида (в данном случае бизонов) говорится в статье Шапиро с соавторами (Shapiro et al. 2004). В дальнейшем тем же методом удалось вычислить динамику популяций мамонтов (Barnes et al. 2007,

Palkopoulou et al. 2013, Chang et al. 2017), овцебыков (Campos et al. 2010), шерстистых носорогов (Lorenzen et al. 2011, Lord et al. 2020), саблезубых тигров (Paijmans et al. 2017), карибу (Lorenzen et al. 2001, Kuhn et al. 2010), лошадей (Lorenzen et al. 2011), медведей (Stiller et al. 2010, Edwards et al. 2011), львов (Barnett et al. 2009) и других животных.

О наших исследованиях древней ДНК в осадочных породах с целью определить, когда и почему вымерли мамонты на острове Св. Павла на Аляске, рассказано в работе Грэхема с коллегами (Graham et al. 2016). Роджерс и Слаткин (Rogers, Slatkin 2017) по данным ядерной геномики показывают, что последние мамонты на острове Врангеля выродились и вымерли из-за последствий близкородственного скрещивания.

Гипотезу о ранней волне распространения людей из Африки поддерживают генетические данные о гибридах с неандертальцами в Германии и Бельгии (PeyrÉgne 2019) и останки, приписываемые Homo sapiens возрастом более 70 000 лет, найденные в Китае (Liu et al. 2015) и Израиле (Hershkovitz et al. 2018). Анализ датировки археологических находок в Маджедбебе в Австралии дает Кларксон с коллегами (Clarkson et al. 2017). О том, что говорят исследования осадочных пород о начале изменений окружающей среды на юго-востоке Австралии, рассказывает ван дер Каарс с коллегами (Van der Kaars et al. 2017). Данные, что в Австралии человек охотился на Genyornis, приводит Миллер с соавторами (Miller et al. 2016).

Время и маршруты распространения человека из Африки по всей планете по данным древней ДНК кратко описаны у Рейха (Reich 2016). О том, как ученые использовали древнюю ДНК бизонов, чтобы исключить, что свободный ото льдов коридор мог послужить потенциальным маршрутом расселения первых людей и колонизации средней части американского континента, рассказывает Хейнцман с коллегами (Heintzman et al. 2016). Время и порядок заселения людьми тихоокеанских островов на основании ДНК крыс реконструировали Матису-Смит и Робинс (Matisoo-Smith, Robins 2004).

Вину людей в вымирании новозеландских моа доказал Аллентофт с соавторами (Allentoft et al. 2014). Отношения охотников и добычи на Шри-Ланке, позволяющие сохранять стабильную популяцию, описаны в статье Лэнгли и ее коллег (Langley et al. 2020).

О кончине Одинокого Джорджа в первый день нового 2019 года сообщила Кристи Уилкокс (Wilcox 2019).

Литература

Allentoft M. E. et al. 2014. Extinct New Zealand megafauna were not in decline before human colonization. Proceedings of the National Academy of Sciences 111: 4922–4927.

Barnes I. et al. 2007. Genetic structure and extinction of the woolly mammoth. Current Biology 17: 1072–1075.

Barnett R. et al. 2009. Phylogeography of lions (Panthera leo) reveals three distinct taxa and a Late Pleistocene reduction in genetic diversity. Molecular Ecology 18: 1668–1677.

Barnosky A. D. et al. 2004. Assessing the causes of Late Pleistocene extinctions on the continents. Science 306: 70–75.

Campos P. et al. 2010. Ancient DNA analysis excludes humans as the driving force behind Late Pleistocene musk ox (Ovibos moschatus) population dynamics. Proceedings of the National Academy of Sciences 107: 5675–5680.

Ceballos G. et al. 2017. Biological annihilation via the ongoing sixth mass extinction signaled by vertebrate population losses and declines. Proceedings of the National Academy of Sciences 114: E6089 – E6096.

Chang D. et al. 2017. The evolutionary and phylogeographic history of woolly mammoths: A comprehensive mitogenomic analysis. Scientific Reports 7: 44585.

Clarkson C. et al. 2017. Human occupation of northern Australia by 65,000 years ago. Nature 547: 306–310.

Edwards C. J. E. et al. 2011. Ancient hybridization and a recent Irish origin for the modern polar bear matriline. Current Biology 21: 1–8.

Graham R. W. et al. 2016. Timing and cause of mid-Holocene mammoth extinction on St. Paul Island, Alaska. Proceedings of the National Academy of Sciences 113: 9310–9314.

Heintzman P. D. et al. 2016. Bison phylogeography constrains dispersal and viability of the «Ice Free Corridor» in western Canada. Proceedings of the National Academy of Sciences 113: 8057–8063.

Hershkovitz I. et al. 2018. The earliest modern humans outside of Africa. Science 359: 456–459.

Koch P. L., Barnosky A. D. 2006. Late Quaternary extinctions: State of the debate. Annual Reviews of Ecology and Evolution 37: 215–250.

Kosintsev P. et al. 2019. Evolution and extinction of the giant rhinoceros Elasmotherium sibricum sheds light on Late Quaternary megafaunal extinctions. Nature Ecology and Evolution 3: 31–38.

Kuhn T. S. et al. 2010. Modern and ancient DNA reveal recent partial replacement of caribou in the southwest Yukon. Molecular Ecology 19: 1312–1318.

Langley M. C. et al. 2020. Bows and arrows and complex symbolic displays 48,000 years ago in the South Asian Tropics. Science Advances 6: eaba3831.

Liu W. et al. 2015. The earliest unequivocally modern humans in southern China. Nature 526: 696–699.

Lord E. et al. 2020. Pre-extinction demographic stability and genomic signatures of adaptation in the woolly rhinoceros. Current Biology 5: 3871–3879.

Lorenzen E. D. et al. 2011. Species-specific responses of Late Quaternary megafauna to climate and humans. Nature 479: 359–364.

Matisoo-Smith E., Robins J. H. 2004. Origins and dispersals of Pacific peoples: Evidence from mtDNA phylogenies of the Pacific rat. Proceedings of the National Academy of Sciences 101: 9167–9172.

Miller G. et al. 2016. Human predation contributed to the extinction of the Australian megafaunal bird Genyornis newtoni ~47ka. Nature Communications 7: 10496.

Paijmans J. L. A. et al. 2017. Evolutionary history of saber-toothed cats based on ancient mitogenomics. Current Biology 27: 3330–3336.e5.

Palkopoulou E. et al. 2013. Holarctic genetic structure and range dynamics in the woolly mammoth. Proceedings of the Royal Society of London, Series B 280: 20131910.

PeyrÉgne S. et al. 2019. Nuclear DNA from two early Neandertals reveals 80,000 years of genetic continuity in Europe. Science Advances 5: eaaw5873.

Reich D. 2018. Who We Are and How We Got Here. Oxford: Oxford University Press. [Райх Д. Кто мы и как сюда попали. М.: Corpus, 2020.]

Rogers R. L., Slatkin M. 2017. Excess of genomic defects in a woolly mammoth on Wrangel Island. PLoS Genetics 13: e1006601.

Shapiro B. et al. 2004. Rise and fall of the Beringian steppe bison. Science 306: 1561–1565.

Stiller M. et al. 2010. Withering away – 25,000 years of genetic decline preceded cave bear extinction. Molecular Biology and Evolution 27: 975–978.

Stuart A. J. 2014. Late Quaternary megafaunal extinctions on the continents: A short review. Geological Journal 50: 338–363.

Stuart A. J., Lister A. M. 2012. Extinction chronology of the woolly rhinoceros Coelodonta antiquitis in the context of Late Quaternary megafaunal extinctions in northern Eurasia. Quaternary International 51: 1–17.

Van der Kaars S. et al. 2017. Humans rather than climate the primary cause of Pleistocene megafaunal extinction in Australia. Nature Communications 8: 14142.

Wilcox C. January 8, 2019. Lonely George the tree snail dies, and a species goes extinct. National Geographic.

Глава 4. Переносимость лактозы

Аннотированная библиография

Современная картина представлений об эволюции и функциональных последствиях мутации сохранения продукции лактазы (переносимости лактозы) у людей представлена в обзоре Сегурель и Бон (SÉgurel, Bon 2017). Чтобы рассчитать хронологию появления мутации переносимости лактозы и проследить, как она распространялась по Евразии (SÉgurel et al. 2020) и Африке (Tishkoff et al. 2007), были привлечены генетические данные. У первых популяций, научившихся доить скот и перерабатывать молоко, не найдено почти никаких следов этой мутации (Burger et al. 2020).

Обзор всех археологических данных по процессу одомашнивания животных в Леванте и распространения домашних животных в Европу предлагает Зедер (Zeder 2011). Роль целенаправленного скрещивания в ранний период одомашнивания оценивает Маршалл с коллегами (Marshall et al. 2014). Три пути одомашнивания очерчены у Зедер (Zeder 2012, 2015). Совокупность общих для домашних животных черт, в начале XX века получившая название «синдром одомашнивания», описан у Уилкинса с соавторами (Wilkins et al. 2014).

Сравнение сельского хозяйства у людей и муравьев приводит Шульц с коллегами (Schultz et al. 2005).

Древняя ДНК расширила наши представления о том, где и когда были одомашнены многие виды (обзор см. в работе Frantz et al. 2020), в частности, собаки (BergstrÖm et al. 2020), куры (Wang et al. 2020) и лошади (Orlando 2020). Время экспансии первых коневодов и ее последствия обсуждаются в статье Хаака с коллегами (Haak et al. 2015) и де Барроса Дамгаарда с коллегами (De Barros Damgaard et al. 2018).

Открытия в области истории одомашнивания крупного рогатого скота, сделанные благодаря исследованиям генома, описывают Парк с коллегами (Park et al. 2015) и Вердуго с коллегами (Verdugo et al. 2019). Сколько, по имеющимся данным, было очагов одомашнивания крупного рогатого скота на планете – два или три, – обсуждают Питт и соавторы (Pitt et al. 2019). Арбакл и его коллеги (Arbuckle et al. 2016) описывают археологические исследования остатков туров из Джааде (Helmer et al. 2005) и Чайоню (Hongo et al. 2009) в более широком контексте одомашнивания крупного рогатого скота в Плодородном полумесяце. Кью с коллегами (Qiu et al. 2012) выделяет в геномах тибетских коров участки, свидетельствующие о скрещивании с местными яками, благодаря чему эти животные могут жить высоко в горах.

В число археологических свидетельств потребления и переработки молока входят следы жиров на стенках керамических сосудов в Европе (Evershed et al. 2008) и Африке (Grillo et al. 2020), а также белковые цепочки, полученные при анализе ископаемого зубного налета (Warinner et al. 2014; см. Charlton et al. 2019, где приведен обзор этой методики и рассказано, какие открытия были сделаны с ее помощью).

Данные о социальных когнитивных способностях у собак исследовали Хэйр и Томазелло (Hare, Tomasello 2005; см. также Hare, Woods 2013, Хэйр, Вудс 2014). В работах Сайто с соавторами (Saito et al. 2019) и Витейл и Аделл (Vitale, Udell 2019) показано, что и у кошек в ходе эволюции появились черты, свидетельствующие о социальной зависимости от компаньонов-людей.

Недавно начавшееся одомашнивание морских видов описал Дуарте с коллегами (Duarte et al. 2007), а растущее значение биотехнологий в сельском хозяйстве изучает Стокстад (Stokstad 2020). Рознер (Rosner 2014) рассматривает современные попытки окультурить новые виды диких растений, в том числе апиос американский.

Как биотехнологии XX века расширили наши научные знания о разведении крупного рогатого скота и о молочном хозяйстве, пишут Мур и Хаслер (Moore, Hasler 2017). О некоторых недостатках этих технологий, которые сказываются до сих пор, пишет Хансен (Hansen 2020); в частности, он объясняет, почему пересадка эмбрионов так и не оправдала всех возложенных на нее надежд. Вклад геномных данных в селекцию современного крупного рогатого скота оценивает Уигганс с коллегами (Wiggans et al. 2017).

О связи мутации гена SLC2A9 с избыточной выработкой мочевой кислоты у далматинцев пишет Баннаш с соавторами (Bannasch et al. 2008), а Льюис и Меллерш (Lewis, Mellersh 2019) отмечают, что после введения ДНК-тестирования частотность этой болезни у собак снижается.

Литература

Arbuckle B. S. et al. 2016. Documenting the initial appearance of domestic cattle in the eastern Fertile Crescent (northern Iraq and western Iran). Journal of Archaeological Science 72: 1–9.

Bannasch D. et al. 2008. Mutations in the SLC2A9 gene cause hyperuricosuria and hyperuremia in the dog. PLoS Genetics 4: e1000246.

BergstrÖm A. et al. 2020. Origins and genetic legacy of prehistoric dogs. Science 370: 557–564.

Burger J. et al. 2020. Low prevalence of lactase persistence in Bronze Age Europe indicates ongoing strong selection over the last 3,000 years. Current Biology 30: 4307–4315.

Charlton S. et al. 2019. New insights into Neolithic milk consumption through proteomic analysis of dental calculus. Archaeological and Anthropological Sciences 11: 6183–6196.

Craig O. E. et al. Did the first farmers of central and eastern Europe produce dairy foods? Antiquity 79: 882–894.

De Barros Damgaard P. et al. 2018. The first horse herders and the impact of early Bronze Age steppe expansions into Asia. Science 360: eaar7711.